Alain Pinton

Ingénieur de recherche INRAE dans l’UMR 1388 GenPhySE (NRE ENVT ENSAT - Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage) à l’Ecole nationale vétérinaire de Toulouse. Animateur de l’équipe Cytogene (Cytogénomique structurale et fonctionnelle) dont les recherches visent à comprendre comment l’information génétique est structurée et transmise entre cellules, entre individus et entre populations et d’étudier l’influence de l’organisation du génome sur son fonctionnement. Cette recherche se décline autour de 3 axes : 1) analyse de la structure des génomes d’espèces animales d’élevage et étude de leurs variations structurelles, 2) caractérisation de la diversité génétique des populations d’abeilles, 3) étude de l’organisation fonctionnelle des génomes lors de la différenciation cellulaire et en présence de variations de structure. Responsable de la plateforme de contrôle chromosomique de l’équipe Cytogene qui analyse le statut chromosomique de populations d’espèces animales d’élevage.

Nos recherches visent à mieux comprendre la contribution des variants de structure du génome à la variabilité génétique et phénotypique des espèces d’élevage. En effet, la variabilité de structure contribue de manière substantielle à la variabilité génétique et a potentiellement un fort impact sur la variabilité phénotypique. Ces variants affectent le plus souvent des régions non codantes mais impactent significativement la structure linéaire du génome et donc potentiellement sa structure 3D. Cette structure 3D est complexe, dynamique et déterminante pour une exécution précise des programmes transcriptionnels régissant les processus cellulaires. Nos recherches visent donc à identifier, caractériser et analyser l’impact des variations de structure sur l’organisation tridimensionnelle du génome et sur son fonctionnement via des approches cytogénétiques (caryotypage, FISH 2D, FISH 3D) et génomiques haut débit (NGS, HiC).

PolledHiC : analyse de l’impact de duplications associées au phénotype sans-cornes chez le bovin sur l’organisation de la chromatine. Etude de la variabilité de structure dans les populations animales, de son impact sur l’organisation tridimensionnelle du génome et son fonctionnement.