Biographie
Jean-Luc Guérin est diplômé de l'Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse en 1995. Il a ensuite suivi un cursus de formation à la recherche et obtenu un master puis un Doctorat de l’Université Paris XI en virologie. Il a obtenu son habilitation à diriger des recherches (HDR) en 2013. Il est diplômé du collègue européen de pathologie aviaire (ECPVS) depuis 2009 et dirige un programme de résidanat dans cette spécialité. Il est professeur en aviculture et pathologie aviaire à l’ENVT, responsable de l’équipe de virologie de l’UMR INRAE-ENVT IHAP et de la chaire de biosécurité aviaire. Jean-Luc Guérin est Directeur de l’UMR IHAP depuis Septembre 2021.
Recherche
L’activité de recherche de Jean-Luc Guérin est menée dans l’Unité de recherche mixte INRAE-ENVT IHAP : elle est consacrée à l’étude des virus des volailles et du lapin, pour identifier des virus émergents et leurs facteurs d’adaptation aux hôtes, en lien avec la biosécurité et la surveillance des systèmes d’élevage. Il s’est particulièrement consacré à l’étude de la pathogénicité et du tropisme des virus influenza aviaires chez différentes espèces aviaires. Depuis plusieurs années, il s’intéresse à l’application des outils de séquençage de nouvelle génération à la détection de virus émergents.
Sélection de 5 publications (3 dernières années) :
- Vergne T, Gubbins S, Guinat C, Bauzile B, Delpont M, Chakraborty D, Gruson H, Roche B, Andraud M, Paul M, Guérin JL. Inferring within-flock transmission dynamics of highly pathogenic avian influenza H5N8 virus in France, 2020. Transbound Emerg Dis. 2021 Jun 25.
- Bessière P, Fusade-Boyer M, Walch M, Lèbre L, Brun J, Croville G, Boullier S, Cadiergues MC, Guérin JL. Household Cases Suggest That Cats Belonging to Owners with COVID-19 Have a Limited Role in Virus Transmission. Viruses. 2021 Apr 14;13(4):673.
- Gaide N, Foret-Lucas C, Figueroa T, Vergne T, Lucas MN, Robertet L, Souvestre M, Croville G, Le Loc'h G, Delverdier M, Guérin JL. Viral tropism and detection of clade 2.3.4.4b H5N8 highly pathogenic avian influenza viruses in feathers of ducks and geese. Sci Rep. 2021 Mar 15;11(1):5928.
- Souvestre M, Guinat C, Niqueux E, Robertet L, Croville G, Paul M, Schmitz A, Bronner A, Eterradossi N, Guérin JL. Role of Backyard Flocks in Transmission Dynamics of Highly Pathogenic Avian Influenza A(H5N8) Clade 2.3.4.4, France, 2016-2017. Emerg Infect Dis. 2019 Mar;25(3):551-554.
- Croville G, Le Loc'h G, Zanchetta C, Manno M, Camus-Bouclainville C, Klopp C, Delverdier M, Lucas MN, Donnadieu C, Delpont M, Guérin JL. Rapid whole-genome based typing and surveillance of avipoxviruses using nanopore sequencing. J Virol Methods. 2018 Nov;261:34-39.
Projets
- 2015-2018 : Projet LabCom VIRAL (lauréat ANR). Porteur du projet.
- 2017-2021 et 2021-2025 : Chaire de biosécurité et de Santé Aviaires – Ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation. Porteur du projet.
- 2020-2022 : Projet FIELD « Fast Identification of Emergence using Long-read sequencing Devices» - Institut Carnot France Futur Elevage & Pasteur Microbes-Santé. Porteur du projet.
- 2021-2022 : projet FSPI coordonné par FVI : Formation en pathologie aviaire en Ethiopie. Responsable pédagogique.
Enseignements
L’activité d’enseignement théorique et clinique en aviculture et pathologie aviaire concerne essentiellement la formation vétérinaire initiale à l’ENVT et dans d’autres établissements vétérinaires ou agronomiques (Vet Agro Sup – Lyon ; bordeaux Sciences Agro ; INP-ENSAT). L’activité pédagogique s’effectue largement sous forme d’interventions cliniques dans les élevages et d’ateliers d’autopsie. Elle est très intégrée aux projets de recherche clinique. Par ailleurs, Jean-Luc Guérin est Directeur d’un programme de résidanat en pathologie aviaire accrédité par le collège européen ECPVS et il pilote la spécialité à l’échelle nationale, en collaboration avec les autres établissements français. Des actions de formation en pathologie aviaire sont également menées en Afrique, au Maghreb et en Ethiopie.